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人源化模型是块砖,哪里需要哪里搬?来了解各类位点突变致病研究

人阅读 发布时间:2023-12-20 11:51

走进「罕见病十宗罪」专栏,为你解密罕见疾病的发生发展机制、行业研究进展(基因治疗等)、推动成果转化的临床前创新策略(模型构建及药物筛选等)。
 

基因突变是指基因在结构上发生碱基对组成或排列顺序的改变,它可以发生于编码序列,也可发生在启动子、内含子和剪切位点等非编码序列,即哪里都可能踩中雷区,触发一系列的致病风险。本期让我们来了解一下,在各类基因序列位点上,不同基因所发生的热点致病突变。如:

 

  • ELP1内含子点突变IVS20+6T>C,导致家族性自主神经功能异常
  • DMPK基因3’非翻译区不稳定的CTG重复片段异常扩增,引起强直性肌营养不良
  • DUX4启动子附近区域甲基化异常,导致面肩肱型肌营养不良症


家族性自主神经功能异常

家族性自主神经失调综合征(Familial dysautonomia syndrome, FD)是一种少见的家族性常染色体隐性遗传病,主要以神经功能障碍、特别是自主神经失调为特征的一组临床症状。该病又称Riley-Day综合征、家族性自主神经功能不全症、中枢性自主神经不全综合征等。

 

超过9%的FD个体的纯合突变为ELP1基因的20内含子发生IVS20+6T>C突变,这种突变破坏了U1小核核糖核蛋白与内含子20供体剪接位点的碱基配对,导致外显子20编码序列的跳跃。该转录本的错误剪接在转录本中引入了移码,并且该mRNA的翻译产生截短的79kDa蛋白质[1-2]

 

使用小鼠模型研究改变人类细胞剪接过程是充满挑战的,因为两者剪接过程不同[3],对于该内含子点突变导致的疾病研究更是如此。已有文献表明,纯合敲除该基因会导致胚胎致死;而直接在野生型小鼠中表达带有人源突变的基因,可能由于表达了正常水平的内源性小鼠ELP1,故没有明显疾病表型[4-6]。为此,赛业生物自主研发了ELP1全基因组人源化小鼠,及在此基础上构建的热门点突变人源化疾病模型。

 

面肩肱型肌营养不良症

面肩肱型肌营养不良症(Facioscapulohumeral muscular dystrophy, FSHD)是最常见的肌营养不良症之一,为常染色体显性遗传。临床表现为进行性、不对称性(或对称性)的肌无力和肌萎缩,虽然病情进展相对缓慢,但致残率高,约20%患者需坐轮椅,严重影响生存质量。

 

临床上将FSHD分为两种类型:FSHD1和FSHD2,尽管两种类型的致病机制不同,但最终结果都是甲基化程度降低,导致DUX4(double homeo-box4)基因在骨骼肌中异常表达或DUX4蛋白功能异常[7]。DUX4是一种毒性转录因子,激活数百个下游基因,损害肌肉发育,激活免疫反应,增加氧化应激敏感性,最终导致细胞死亡途径的激活。

 

目前,该疾病临床前管线研究中多使用FLExDUX4小鼠[8],这是一种诱导模型,构建复杂,早期的模型多使用AAV递送DUX4构建疾病模型[9]。为此,赛业生物自主研发了下一代AAV递送DUX4构建疾病模型,可以在几周内快速造模,用于疾病临床前研究。

 

萎缩性肌强直

萎缩性肌强直亦称“强直性肌营养不良”(Myotonic dystrophies, DMs)是常染色体显性遗传罕见病,突变外显率高,极易出现家族聚集现象,临床异质性高,以肌强直、肌无力、肌萎缩为主要特点。DMs分为强直性肌营养不良Ⅰ型(Dystrophia myotonica 1, DM1)及强直性肌营养不良Ⅱ型(Dystrophia myotonica2, DM2)两个亚型,其中DM1占绝大多数,由DMPK基因3’非翻译区不稳定的CTG重复片段异常扩增引起[10]

 

正常人含5-37个CTG拷贝,DM1患者的拷贝数可扩增至50到数千个不等。一般来讲,当CTG重复数大于37时,就会变得不稳定,容易在有丝分裂或减数分裂过程中扩增。越来越多的证据表明突变的DMPK转录本阻滞在细胞核内,形成分散的聚集灶,通过影响维持细胞发育所需蛋白质的正常功能产生毒性作用。当前研究使用的疾病模型以DMPK转基因(带有多个CTG重复)[11]和HSALR转基因小鼠[12]为主,赛业生物自主构建了这两种转基因模型,能为DM1临床前研究提供更好的模型。

 

HUGO-GTTM全基因组人源化模型构建计划

不仅是上述提及的疾病,针对视网膜色素变性(RP)、黄斑变性(AMD)、帕金森病(PD)等多种疾病类型,如果要深入研究其致病机理,长片段甚至全基因组人源化小鼠是更好的选择。但全基因组替换所需的技术难度高,大规模引入的外源序列可能会影响原本基因的表达调控。

 

为此,赛业生物启动了HUGO-GTTM计划,基于自主研发的TurboKnockout-Pro技术,对鼠源基因实现原位替换,成功构建了涵盖更丰富干预靶点的全基因组人源化小鼠。HUGO-GTTM小鼠搭载了更高效的大片段载体融合技术,可以作为模板进行针对性的突变定制服务,是更贴近真实世界生物机制的药物临床前研究模型。

 

注:HUGO-GTTM即Humanized Genomic Ortholog for Gene Therapy

 

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参考文献:

[1]Carmel I , Tal S , Vig I ,et al.Comparative analysis detects dependencies among the 5′ splice-site positions[J].RNA, 2004, 10(5):828-840.DOI:10.1261/rna.5196404.

[2]Anderson S L , Coli R , Daly I W ,et al.Familial Dysautonomia Is Caused by Mutations of the IKAP Gene[J].The American Journal of Human Genetics, 2001, 68(3):753-758.DOI:10.1086/318808.

[3]Pan Q , Bakowski M A , Morris Q ,et al.Alternative splicing of conserved exons is frequently species-specific in human and mouse.[J].Trends in Genetics, 2005, 21(2):73-77.DOI:10.1016/j.tig.2004.12.004.

[4]Hims M M , Shetty R S , Pickel J ,et al.A humanized IKBKAP transgenic mouse models a tissue-specific human splicing defect.[J].Genomics, 2007, 90(3):389-396.DOI:10.1016/j.ygeno.2007.05.012.

[5]Chen Y T , Hims M M , Shetty R S ,et al.Loss of Mouse Ikbkap, a Subunit of Elongator, Leads to Transcriptional Deficits and Embryonic Lethality That Can Be Rescued by Human IKBKAP[J].Molecular and Cellular Biology, 2009, 29(3):736-744.DOI:10.1128/MCB.01313-08.

[6]Dietrich P , Yue J , Shuyu E ,et al.Deletion of Exon 20 of the Familial Dysautonomia Gene Ikbkap in Mice Causes Developmental Delay, Cardiovascular Defects, and Early Embryonic Lethality[J].Plos One, 2011, 6(10):e27015.DOI:10.1371/journal.pone.0027015.

[7]Ansseau Eugénie,Vanderplanck Céline, Armelle W ,et al.Antisense Oligonucleotides Used to Target the DUX4 mRNA as Therapeutic Approaches in FaciosScapuloHumeral Muscular Dystrophy (FSHD)[J].Genes, 2017, 8(3):93.DOI:10.3390/genes8030093.

[8]Lim K R Q , Maruyama R , Echigoya Y ,et al.Inhibition of DUX4 expression with antisense LNA gapmers as a therapy for facioscapulohumeral muscular dystrophy (vol 117, pg 16509, 2020)[J].Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America.  2020(35):117.

[9]Ba L M W , Garwick S E , Mei W ,et al.DUX4, a candidate gene for facioscapulohumeral muscular dystrophy, causes p53-dependent myopathy in vivo.[J].Annals of Neurology, 2011, 69(3):540-552.DOI:10.1002/ana.22275.

[10]Yin Q , Wang H , Li N ,et al.Dosage effect of multiple genes accounts for multisystem disorder of myotonic dystrophy type 1[J].Cell Research, 2019, 30(2):1-13.DOI:10.1038/s41422-019-0264-2.

[11]Mahadevan M S , Yadava R S , Yu Q ,et al.Reversible model of RNA toxicity and cardiac conduction defects in myotonic dystrophy.[J].Nature Genetics, 2006, 38(9):1066.DOI:10.1038/ng1857.

[12]Mankodi A, Logigian E, Callahan L, McClain C, White R, Henderson D, Krym M, Thornton CA. Myotonic dystrophy in transgenic mice expressing an expanded CUG repeat. Science. 2000 Sep 8;289(5485):1769-73. doi: 10.1126/science.289.5485.1769. PMID: 10976074.

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